Q:柱子上面的墊片實(shí)驗前是否要取出?
A:不用取出
Q:實(shí)驗目的為除去二抗中未結合的酶,NI-NTA His Bind Resin是否適用?
A:不推薦
Q:如何配置破菌緩沖液:
A:1 L 體積
Tris 20 mM (6M HCl調pH值到7.4) 2.42 g
NaCl 250 mM 14.6 g
PMSF 1 mM 10 mL 100X 儲液
100X PMSF 儲液(1.74 g PMSF 溶解于100 mL異丙醇), -20℃長(cháng)期保存,4℃保存數月,禁止室溫存放
Q:如何配置上樣緩沖液:
A:同破菌緩沖液,可以不加PMSF
Q:如何配置洗雜緩沖液:
A:在上樣緩沖液中添加咪唑至20 mM
Q:如何配置洗脫緩沖液:
A:在上樣緩沖液中添加咪唑至200 mM
Q:目的蛋白不同,緩沖液一樣的配方?
A:上述緩沖液為起始緩沖液,目的蛋白質(zhì)不同,可能需要不同的純化緩沖液。具體使用可以參考分子克隆等工具書(shū)或者文獻對緩沖液做修改。也可以根據蛋白質(zhì)性質(zhì)對上述緩沖液做修改
Q:凍融如何做,反復凍融幾次:
A:從-80°拿出來(lái),再放進(jìn)去反復凍融至少3次
Q:目的蛋白質(zhì)在PH7.4下不穩定:
A:可以在pH7.3-8.3的范圍內對緩沖液的pH調整
Q:200 mM咪唑未洗脫下目的蛋白質(zhì):
A:可以繼續提高咪唑濃度
Q:洗雜蛋白時(shí)目的蛋白質(zhì)也洗脫:
A:加5%甘油,0.1% tritonX100,0.5M NaCl可能會(huì )有效果,起到以下兩個(gè)作用:
(1)減少非特異吸附:甘油,去垢劑(triton),NaCl 都可以減少蛋白間疏水作用降低非特異吸附, 使雜蛋白更容易洗脫;
(2)通過(guò)減少蛋白間疏水作用使HIS-tag暴露的更加靈活,與Ni結合的更緊密,不容易被洗脫。
還有一種方法即洗雜緩沖液中咪唑濃度降低或者不添加
Q:如何再提高蛋白質(zhì)純化的效果:
A:一些情況下,緩沖液中添加5%-10%的甘油,0.1%的tween,0.5M的NaCl會(huì )提高蛋白質(zhì)純化的效果。
Q:破菌時(shí)可以用EDTA做蛋白酶抑制劑嗎
A:可以適當加入PMSF作為蛋白酶抑制劑,但是不能使用EDTA。
Q:破菌時(shí)可以用DTT做還原劑嗎
A:還原劑使用2 mM 2-ME,避免使用DTT,因為DTT會(huì )造成Ni/Co離子還原
Q:破菌緩沖液可以用PBS嗎
A:可以
Q:我購買(mǎi)的是1ml預裝柱,十倍柱體積平衡是指10ml上樣緩沖液平衡嗎
A:是
Q:一個(gè)過(guò)程下來(lái)需要多長(cháng)時(shí)間?正常流速每秒多少滴
A:重力柱,一般1s流速50ul左右
機械柱可以?xún)x器調節,一般跟重力柱比可以快50-100%
Q:如果流速過(guò)慢,怎么處理
A:可以使用硅膠管控制上樣速度?;蝾A裝柱下面接軟管,再接蠕動(dòng)泵
Q:正常流速過(guò)一次柱就可以充分結合了嗎?是否需要多過(guò)幾次柱?
A:一次就可以,如果流速過(guò)快,可以再過(guò)一次
Q:上樣完成后,是否可直接進(jìn)入洗雜步驟
A:樣品上完以后,使用上樣緩沖液洗柱10個(gè)柱體積,注意將純化柱側壁上的殘留樣品洗干凈。
Q:如何洗去雜蛋白
A:使用10-20倍柱體積洗雜緩沖液將雜蛋白從純化柱上洗去,如果雜蛋白太多可以加大洗雜體積。
Q:如何判定洗雜步驟已經(jīng)完成
A: 一般10個(gè)柱體積即為洗雜步驟完成。
Q:雜帶多,雜蛋白洗不掉怎么辦
A:增加咪唑濃度,若仍無(wú)好轉,嘗試下:洗雜液中添加NaCl到150mM【Nacl濃度最高不要超過(guò)500mM】,TritonX100到1%【作用去掉柱料的一些非特異性吸附】,甘油到5%
Q:如何洗脫目的蛋白
A:洗雜結束以后,使用4-10倍柱體積洗脫緩沖液將目標蛋白洗脫。通常目標蛋白會(huì )在第二個(gè)柱體積中開(kāi)始流出。
Q:難以洗脫目的蛋白
A:難以洗脫的蛋白最高可用咪唑濃度500mM,或者EDTA連同鎳離子一起洗脫(不得已的辦法)。
Q:如何判斷收集的液體中有目的蛋白
A:收集液中的目的蛋白質(zhì)用SDS-PAGE檢測。
Q:純化完成后如何處理柱子/保存柱子
A:收集完成以后,使用8M尿素或者6M鹽酸胍5倍柱體積洗柱,再使用大量蒸餾水水洗柱,封閉純化管上下兩端保存在4 ℃,不要在-20 ℃凍結。如果長(cháng)期不用,加入5 ml 20%乙醇封閉保存。
Q:哪些情況下需要鎳柱重生
A:His?Bind Resin可以多次使用,不需要再生。如果需要使用一根柱子純化不同目標蛋白,或者長(cháng)時(shí)間使用造成金屬離子脫落,柱子堵塞、流速慢,可以按照下述方法進(jìn)行再生。
Q:如何重生
A:1. 用0.1 M EDTA洗柱4倍柱體積,將金屬離子洗脫下來(lái),再用蒸餾水洗柱10倍柱體積除去EDTA殘留。
2. 使用0.2 M醋酸洗柱4倍柱體積,10倍柱體積蒸餾水沖洗,再用0.1M 氫氧化鈉洗柱4倍柱體積, PBS/TBS平衡pH,大量蒸餾水洗柱。這一步需要避免強酸、強堿洗柱時(shí)間過(guò)長(cháng)。
3. 用4%氯化鎳或者硫酸鎳3倍柱體積重新螯合10分鐘,也可以使用4%氯化鈷或者硫酸鈷螯合柱子。
4. 柱子長(cháng)時(shí)間不用,加入20% 乙醇,封口后于4攝氏度保存,避免干裂或者凍結。
Q:可以重復用多少次
A:10-20次
Q:重生后效果如何?與初始狀態(tài)相比可以達到多少?
A:至少95%
Q:堵柱嚴重,怎么辦
A:如果柱子堵塞嚴重,重生時(shí)使用1% Triton X-100/PBS浸泡過(guò)夜。
Q:螯合鎳時(shí)間太長(cháng),有時(shí)一天,是否會(huì )影響效果
A:沒(méi)有影響
Q:使用過(guò)程中發(fā)現堵塞嚴重,且流速越來(lái)越慢
A:樣品處理過(guò)程中,高速離心,最好用0.45um的濾膜過(guò)濾(推薦)
如果柱子堵塞嚴重,重生時(shí)使用1% Triton X-100/PBS浸泡過(guò)夜。
流速慢,可再柱子下面接一根軟管。
Q:如何保存
A:20%乙醇保存;4℃保存,1年有效。
Q:是否必須冰上操作?常溫是否可以?
A:在未知Ni-NTA His?Bind Resin融合蛋白穩定性的情況下,整個(gè)純化過(guò)程最好在4℃完成
Q:是否可以用EDTA
A:可以使用蛋白酶抑制劑防止降解,但是EDTA應當在純化完成以后再加入。
Q:是否可以使用非離子去垢劑改善結合?具體濃度?
A:可以,具體使用濃度參考以下:1% Triton X-100,1% Tween-20,0.03% SDS,0.1% NP-40。
Q:購買(mǎi)的1ml預裝柱可以結合多少蛋白
A:每根1 ml的His?Bind Resin親和柱一次可以結合大約20 -30 mg His-tag融合蛋白
Q:我們的樣品種類(lèi)較多,可以用同一根柱子嗎
A:最好不同的融合蛋白使用不同的柱子,樣品較多,可以使用多根柱子,或者純化完一種樣本后需重生后再純化另外一種蛋白。
Q:有哪些方法可以減少雜蛋白的結合
A:上樣緩沖液中可以含有1 mM咪唑減少雜蛋白的結合
Q:我的目的蛋白在咪唑20mM時(shí)就掉下來(lái)了
A:部分目標蛋白會(huì )在20 mM咪唑洗雜緩沖液中流出,所以對于新樣品,每一步都要留樣電泳,摸索純化條件。
Q:我的目的蛋白是包涵體形式,如何變性
A:如果融合蛋白是包涵體形式,那么可以選擇變性純化方法,通常是在緩沖液中加入8M 尿素以及去垢劑。變性純化時(shí)一定要做好樣品處理,不然容易造成柱子堵塞。
Q:變性后的蛋白如何處理
A:變性方法得到的蛋白一般沒(méi)有活力,可以用來(lái)制備抗體,但如想測定活力,就需要做復性。
Q:變性蛋白如何復性
A:蛋白質(zhì)復性方法有很多種,稀釋法、透析法、離子交換復性法,分子篩復性法,自己選擇合適的方法來(lái)做。
Q:除了可以咪唑洗脫,還有其他方法可以洗脫嗎
A:除了常規的咪唑洗脫方法以外,還有EDTA洗脫和pH梯度洗脫。后兩種方法缺點(diǎn)明顯,只在特殊情況下使用。
Q:去除his 標簽的方法
A:可以使用在柱酶切的方法得到去除His-tag的目標蛋白。經(jīng)常使用的酶包括:Thrombin;Enterokinase;TEV protease等。我們推薦TEV protease(貨號:RPP002),因為這種酶的特異性較好,是帶有Ni-NTA His?Bind Resin的重組酶,方便除去。在柱酶切可以提高產(chǎn)物純度,但是空間位阻可能造成酶切效果不好,按照慣例,多數實(shí)驗不用切除Ni-NTA His?Bind Resin。
Q:金屬離子脫落,柱子失去顏色或者變色
A:確證破菌緩沖液中不含有EDTA、EGTA、檸檬酸、DTT等螯合劑;重新處理柱子,為His-Binding-resin螯合金屬離子。
Q:融合蛋白是包涵體
A:降低表達溫度(16-22℃),降低IPTG誘導濃度(10-100 μM),縮短誘導時(shí)間(2-5小時(shí));做包涵體復性,或者使用變性純化。
Q:表達量太低
A:換載體或者優(yōu)化密碼子序列。
Q:融合蛋白不結合
A:測序檢查核酸序列,將tag從一端移到另一端,增加接頭序列。
Q:純化的蛋白沒(méi)有活性
A:調整破菌條件,超聲產(chǎn)生的熱量可能使GST蛋白變性。
Q:融合蛋白被蛋白酶降解
A:在破菌緩沖液中加入蛋白酶抑制劑,縮短純化時(shí)間,降低溫度。
Q:融合蛋白不能從柱子上洗脫
A:加入0.1% TritonX-100;增加NaCl濃度;使用變性純化。
Q:融合蛋白被蛋白酶降解
A:在破菌緩沖液中加入蛋白酶抑制劑,縮短純化時(shí)間,降低溫度。
Q:有些宿主細胞的分子伴侶蛋白會(huì )與融合蛋白結合
A:上樣前加入5 mM DTT,或者使用10 mM MgSO4 50 mM Tris,2 mM ATP先反應20分鐘,讓伴侶蛋白去結合。
Q:超聲裂菌過(guò)度,目標蛋白被打斷
A:注意超聲儀的工作功率以及超聲時(shí)間,使用顯微鏡控制裂菌。
Q:金屬離子親和柱非常容易產(chǎn)生非特異性吸附,特別是在目標蛋白表達量較低時(shí)
A:在上樣緩沖液中加入去垢劑,可以有多種選擇;加大目標蛋白上樣量;減少bead使用量;加大鹽離子濃度;咪唑梯度洗脫;變性純化等等。
Q:PMSF是否可以不加
A:PMSF為蛋白酶抑制劑,作用是防止目的蛋白被降解,可以不加
Q:破菌液中加咪唑嗎
A:可以不加,如一定要加,建議可以加1-5mM,加了會(huì )競爭結合,減少雜蛋白的結合,增加雜蛋白的穿出
Q:重復使用,效率不高,怎么辦
A:在第一次使用后,處理一下“8mol 尿素 沖洗(1ml鎳柱對應20ml尿素),用水沖洗干凈尿素,上0.1mol 硫酸鎳 (1ml鎳柱對應1ml硫酸鎳)”,然后再進(jìn)行后面的操作
Q:柱子上面的墊片實(shí)驗時(shí)是否需要取出,墊片是什么作用
A:不要取出,墊片的作用:1、擋住臟東西;2、防止膠飄起來(lái)
Q:結合不到蛋白或結合力弱
A:1. Binding buffer(或者細胞裂解buffer)
咪唑濃度不要超過(guò)5mM,NTA和HIS-Tag的結合力較弱所以最好不加咪唑,先把蛋白binding上去再洗雜蛋白;
PH中性或偏堿(PH 7.0-8.5)酸性條件下蛋白很難和鎳柱結合;
buffer中不要有EDTA(可以螯合鎳),DTT等還原劑(可以還原鎳)。
2. 蛋白特性
蛋白折疊后his-tag被包裹在內部,無(wú)法暴露出來(lái)與鎳柱結合; 可以嘗試在蛋白中加入變性劑尿素(2M-8M)在部分或完全變性 的條件下純化蛋白。
Q:不掛柱
A:不掛柱的情況比較常見(jiàn),一般是蛋白的問(wèn)題,與填料本身沒(méi)有關(guān)系,建議重新構建克隆試下
Q:來(lái)源于哪些表達系統的His蛋白有很好的純化效果(原核?真核?例如桿狀病毒/哺乳細胞/酵母/細菌等)
A:只要目的蛋白質(zhì)帶His標簽都可以用鎳柱純化,注意分泌表達的蛋白質(zhì),如果培養基中含有復雜的成分,其中可能含有還原劑或螯合劑,此時(shí)培養基上清不能直接用鎳柱純化,應當先將培養基脫鹽處理再上柱純化。
Q:蛋白量少,推薦用多大規格的預裝柱
A:正常20mg/ml的載量,推薦小規格預裝柱
Q:上清渾濁,是用IDA好還是NTA好
A:上清渾濁,推薦適當稀釋上清,并在此離心或者過(guò)0.45um濾膜處理。IDA或NTA都可純化。
Q:如何自己裝柱(重力柱)
A:參考裝柱說(shuō)明,詳詢(xún)請咨詢(xún)技術(shù)人員
Q:蛋白大小27KD,是否可用我們的鎳柱
A:可以
Q:預裝柱純化過(guò)程中,流速越來(lái)越慢,除了加硅膠管,還有什么方法
A:推薦再生柱料。
Q:我在純化時(shí)變性緩沖液里加入巰基乙醇,對鎳柱是否有影響?如果不用巰基乙醇會(huì )有什么影響?
A:不加是沒(méi)有影響的,不過(guò)有些蛋白可能會(huì )出現沉淀的情況,這個(gè)要看蛋白特性來(lái)看的。巰基乙醇濃度不要超過(guò)10mM,或者5mM DTT
Q:如果表達蛋白中含有半胱氨酸沒(méi)有二硫鍵,在純化時(shí)是否需要加還原劑保護,一般用多大濃度
A:可以不加還原劑,不加還原劑可能會(huì )有20%-30%二硫鍵。如果要全部游離狀態(tài)的話(huà),可以加1mM DTT
Q:純化率達到多少?
A:大部分蛋白可達到95%以上,特殊蛋白情況不定,尤其是包涵體蛋白,可能達不到95%
Q:生物酶是否可以用鎳柱純化
A:可以
Q:洗雜蛋白時(shí),咪唑加到40mM,目的蛋白就會(huì )掉下來(lái),20-30mM雜蛋白又總洗不掉,反復做了幾次,始終收不到想要的蛋白,請問(wèn)有什么建議嗎?
A:20mM洗雜蛋白,洗雜緩沖液中添加NaCl 0.5M,甘油10%,triton X-100 0.5%。 50mM洗脫目的蛋白質(zhì)。
Q:1ml可以加多少蛋白液(菌液)?
A:1mL預裝柱載量可以達到10mg,根據表達的蛋白質(zhì)的量來(lái)決定上樣體積。
Q:融合蛋白鎳柱純化有雜帶,目標蛋白量不算小,但雜帶很明顯。排除目的蛋白被降解的可能。
A:緩沖液中NaCl 0.5M,甘油10%,triton X-100 0.5%。 來(lái)降低非特異性結合。
Q:柱子中有大氣泡,且排不出去。
A:手工重力柱 裝柱時(shí) 有時(shí)里面會(huì )有小氣泡 對于流速和純化都不會(huì )有影響的
如果影響到了流速和純化效果的話(huà),可以加3/4柱體積的 20%乙醇 然后用1ml槍頭將上面的篩片撥動(dòng) 重新裝一下上面的篩片即可
Q:包涵體蛋白,尿素變性后怎么做
A:1. 破菌離心收集包涵體沉淀。
2. 包涵體沉淀用含1%的Triton-100,超聲重懸。再離心收集沉淀。
3. 選作,步驟2再重復一遍。
4. 包涵體沉淀用6M (如果6M不溶,補加尿素到8M)重溶,短暫超聲可以輔助包涵體溶解。
5. 離心,去掉不溶的沉淀。
6. 配置復性緩沖液:含5mM GSH,0.5mM GSSG,10%甘油的PBS或者TBS
7. 復性緩沖液預冷到0-4℃,電磁攪拌旋轉下,將6M尿素中的變性蛋白,慢慢滴加到復性緩沖液中。按照1體積的變性蛋白質(zhì),20-100體積的復性緩沖液的體積比稀釋。
8. 繼續攪拌1小時(shí)。
9. 選作,4℃靜置過(guò)夜。
10. 選作,離心去除未變性的蛋白質(zhì)。如果純重力上樣,推薦做此步,防止柱子堵塞不流。
11. 復性蛋白質(zhì)上NTA-鎳柱純化。
若做的是包涵體蛋白,推薦用NTA-鎳柱(變性液可以直接過(guò)柱),不可用IDA-鎳柱,復性后蛋白會(huì )破壞IDA鎳柱
Q:要用鎳柱做實(shí)驗,樣品大于55kd,為包涵體,原核表達的?
A:可以用6M鹽酸胍變性,然后用帶8M尿素的緩沖液(鎳柱純化全程)
樣品用6M脲變性溶解后,緩沖液也是相同條件,然后用咪唑梯度洗脫即可。
8M脲有點(diǎn)高了,而且不好溶解;6M胍溶液太稠了,溶液流的太慢了(如果用機器,壓力就會(huì )太大)。
Q:1.原核表達蛋白時(shí)如何增加目的蛋白表達量?乳糖取代IPTG效果是否明顯?2.若目的蛋白為包涵體,如何增加最后復性得率?是先復性?還是先純化?3.目的蛋白易降解,在表達、純化和儲存方面需要注意事項
A:1. 原核表達蛋白質(zhì)增加蛋白量需要摸索條件,乳糖替代IPTG誘導有時(shí)候表達量增加有時(shí)候減少。一般規律是如果不容易降解的重組蛋白質(zhì)增加誘導時(shí)間會(huì )增加表達量,容易降解不穩定的蛋白質(zhì)需要摸索一個(gè)誘導時(shí)間,誘導時(shí)間過(guò)長(cháng)會(huì )造成蛋白質(zhì)降解,表達量降低。
2. 包涵體復性液需要摸索不同的復性方法和復性緩沖液。一般推薦先復性再純化。
3. 目的蛋白質(zhì)容易降解,一般需要降低表達時(shí)候的溫度,摸索一個(gè)合適的誘導時(shí)間,純化時(shí)在低溫條件下進(jìn)行,純化時(shí)間要快,盡量誘導結束,盡快收菌、破菌、上柱純化。純化后的蛋白質(zhì)保存嘗試DTT、甘油等保護劑,在-80℃保存。
Q:上樣后剛開(kāi)始慢慢滴,沒(méi)一會(huì )就不滴了,是否可以用洗耳球加壓,控制1s一滴,會(huì )不會(huì )太快。
A:這個(gè)情況是正常的,可以用洗耳球,但是這樣做工作量太大,太累了。建議:
1. 12000rpm 離心10min,如果還是比較渾濁,再離心一次。
2 或者0.45um濾膜過(guò)濾一下。
Q:蛋白裂解液粘稠該如何處理
A:裂解液粘稠是流不下來(lái)的,建議①在超聲儀上做超聲,打斷核酸,裂解液會(huì )變清亮不粘稠,若是包涵體蛋白,達不到清亮但不會(huì )粘稠②反復凍融,有好轉,效果沒(méi)做超聲好③加入benzonase
Q:第一遍過(guò)柱速度慢,不接軟管的情況下可以如何調整加快流速。
A:樣品稀釋?zhuān)档驼吵矶取?
Q:最后一步用8M尿素或鹽酸胍洗柱是否一定要做,加尿素的作用是什么?
A:不是必須步驟,但若不洗,后續純化會(huì )有雜蛋白。加尿素可以使蛋白變性,非特異性結合的蛋白洗下來(lái)。
Q:如何洗去咪唑
A:用水大量沖洗
Q:顏色很淡,會(huì )不會(huì )影響效果?需要重新螯合Ni嗎
A:不影響效果,不用重新螯合。
Q:鎳柱顆粒大小是多少
A:65-160um
Q:未能純化到His標簽蛋白?
A:建議先確認是否為蛋白沒(méi)有掛柱直接流穿?還是蛋白未被洗脫下來(lái)?若排除這兩點(diǎn),我們還總結了以下因素,建議您一一排除:
1、Q:超聲功率不對
A:超聲前加入溶菌酶,改變超聲功率
2、Q:樣品或者結合緩沖液不對
A:檢測PH及樣品盒結合緩沖液的組成份。保證溶液中的螯合劑或強還原劑濃度及咪唑的濃度不高。
3、Q:組氨酸的標簽沒(méi)有完全的
A:在變性條件下(用4-8M脲,或4-6M鹽酸胍)進(jìn)行純化
4、Q:His標簽丟失
A:建議1、檢查His是否表達,上游構建,改變His標簽的位置(C-terminal or N-terminal),必要時(shí)增加His個(gè)數(常用6-10個(gè))
建議2、降低流速、增加孵育時(shí)間
建議3、尋找最佳的結合金屬離子
Ni2+通常是宿主細胞蛋白中純化大多數6個(gè)組氨酸標記重組蛋白的一般常用金屬離子。蛋白和金屬離子之間的結合強度受長(cháng)度、位置、親和標記在蛋白的暴露程度、所用離子的類(lèi)型、以及緩沖液的PH這幾種因素影響,因此一些蛋白用其他離子可能更容易地進(jìn)行純化而不同Ni2+。
Q:目的蛋白洗脫不下來(lái)
1、Q:洗脫條件太溫和(組氨酸標記的蛋白質(zhì)仍然結合在柱上,結合力較強)
A:增加咪唑的梯度或降低PH來(lái)找出最佳的洗脫條件。
2、Q:若您選用降低PH的方法洗脫的,PH低于3.5,會(huì )導致鎳離子脫落
A:改變洗脫方法,咪唑競爭性洗脫
3、Q:蛋白已沉淀在柱上
A:減少上樣量,或使用咪唑的線(xiàn)性梯度而不是分步洗脫以降低蛋白的濃度。試用去污劑或改變NaCL的濃度,或在變性條件(去折疊)下洗脫(用4-8M脲,或4-6M鹽酸胍)。
4、Q:非特異性疏水或其他相互反應
A:洗脫緩沖液中添加非離子去污劑(如2%Triton X-100)或增加NaCL的濃度。
Q:洗脫后雜帶較多,什么原因?如何優(yōu)化?很多天然的蛋白也會(huì )帶有HIS,所以經(jīng)常會(huì )出現HIS標簽蛋白洗脫后有一些雜帶
1、Q:蛋白酶部分降解了標簽蛋白
A:請添加蛋白酶抑制劑。(慎用EDTA)
2、Q:雜質(zhì)對鎳離子有更高的親和性
A:推薦1:優(yōu)化咪唑濃度,以確保宿主細胞蛋白質(zhì)的低結合和組氨酸標記的目標蛋白質(zhì)的強結合之間的最佳平衡。分步或線(xiàn)性洗脫摸出最優(yōu)的咪唑結合和清洗濃度;在樣品中加入與結合緩沖液同樣濃度的咪唑;咪唑的梯度不大(20個(gè)或更多的柱床體積),可能分離出有相似結合強度的蛋白。
推薦2:篩選最適合的緩沖液條件,NaCL濃度,PH的范圍都需要進(jìn)行篩選。
Q:雜質(zhì)和標簽蛋白結合
A:在超聲前加入還原劑或去垢劑;增加去垢劑的濃度,(2%Triton X-100 or2% Tween 20);或者在washing buffer中增加甘油的濃度(50%)減少非特異性的相互反應??紤]增加咪唑的濃度或者改變金屬離子。
Q:洗滌不充分
A:增加洗滌的次數。
Q:蛋白過(guò)鎳柱純化的原理
A:鎳可以與有His標簽的堿性蛋白結合。蛋白上樣后,帶有his標簽的蛋白特異性結合到柱子里,雜蛋白流出。鎳也可以與咪唑結合,咪唑競爭性結合到鎳上,再用咪唑梯度洗脫,目的蛋白就被洗下來(lái)了,收集穿出液,里面就是目的蛋白,再透析掉咪唑。
Q:是否需要孵育?還是直接過(guò)柱流下來(lái),直接結合了?
A:直接過(guò)柱流下來(lái),鎳柱與蛋白結合很快,不需要孵育
Q:推薦的線(xiàn)性流速是多少?
A:fast flow正??梢?cm/min,一般推薦0.5cm/min就已足夠(1ml/min)。
Q:柱子不小心干了,怎么處理?填料出現了結塊
A:可以用20%乙醇或PBS/TBS重懸一下即可。出現結塊用1ml槍吹散。
Q:蛋白表達量較低,洗完之后如何濃縮
A:超濾管濃縮
Q:CHO細胞表達的蛋白,能否用鎳柱純化
A:只要帶his標簽就可以用鎳柱純化。但是蛋白質(zhì)樣品要預處理一下,引物cho細胞培養基上清組分比較復雜,可能影響掛柱。
Q:蛋白樣品如何預處理
A:各種預處理方法,比如超濾去除培養基中大部分氨基酸,硫酸銨沉淀,或者透析,這個(gè)是蛋白純化策略問(wèn)題,不同的樣本量,樣本形式都不一樣。
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