Q:這種直接PCR試劑盒,擴增產(chǎn)物可以做哪些實(shí)驗
A:PCR的產(chǎn)物可以通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳和EB染色進(jìn)行分析,進(jìn)行下游的常規操作,例如限制性酶切、DNA測序、dHPLC分析等
Q:適用樣品
A:酵母、真菌和霉菌等
Q:模板制備需要多久
A:10min內完成模板制備,無(wú)需DNA抽提,樣品處理快鍵
Q:可以應用于哪些領(lǐng)域
A:1、人類(lèi)、其他哺乳動(dòng)物和鳥(niǎo)類(lèi)基因分析;2、可用于常規檢測:限制性酶切、瓊脂糖凝膠電泳/EB染色、熒光毛細管電泳、DNA測序或dHPLC分析
Q:是否需要去除其他RNA、蛋白等
A:提取的DNA可以馬上用于PCR反應,不需要去除其他蛋白、RNA或者次生代謝產(chǎn)物,滿(mǎn)足快速檢測的需要,特別適合大規?;驒z測
Q:樣品預處理
A:直接挑取單克隆進(jìn)行PCR;或采用簡(jiǎn)單預處理步驟:1、用槍頭或牙簽取單克隆,投入40ul預處理液中,95℃水浴10min,10000rpm離心1min,取1-4ul上清進(jìn)行PCR;2、取酵母培養液,離心,吸除培養基,加入20ul預處理液,煮沸2-3min,取1-4ul樣品進(jìn)行PCR,剩樣保存在-20℃
Q:反應體系
A:以40ul體系示例(20-50ul/reaction),在微量離心管中加入以下各種成分
酵母裂解液 | 1-2.5ul |
聚合酶 | 1-2ul |
5*PCR Buffer | 8ul |
dNTP(10mM) | 0.8ul |
Primers | 1-2ul(0.25-1uM終濃度) |
ddH2O | UP to 40ul |
Q:PCR反應參數設置
A:依據擴增產(chǎn)物而定,以2kb的擴增產(chǎn)物為例:94℃ 4 min,35 cycles(94℃ 30 sec,55℃ 30 sec,72℃ 1 min),72℃ 5 min,4℃soak。
Q:我的片段大?。?kb
A:擴增1kb以下片段,30 sec延伸即可;也可采用兩步擴增法(設計引物長(cháng)度22-25bp,68℃退火延伸)
Q:轉化子鑒定
A:鑒定轉化子可以直接挑取單克隆座位PCR模板,但細胞量不能太多,最好控制在10000個(gè)細
Q:裂解液使用量是否有要求
A:聚合酶可以耐受最高10%(V/V)的裂解液,過(guò)量裂解液會(huì )對PCR反應產(chǎn)生抑制并對下游產(chǎn)物分析產(chǎn)生不利影響,大多數情況加入2-5%(V/V)酵母裂解液可以完成PCR反應
Q:如何確認加入模板的最佳范圍
A:初次實(shí)驗,建議加入1%、2.5%和5%(V/V)酵母裂解液
Q:反應為陰性,跟dNTP有關(guān)嗎
A:dNTP容易失效,反應為陰性時(shí),建議增加dNTP用量,或者更換新鮮制備的dNTP
Q:細菌或霉菌樣品如何操作
A:酵母PCR試劑盒可以用于細菌、霉菌或者其他真菌的免抽提PCR,方法一樣
Q:每次反應多少細胞量
A:本酶靈敏度很高,每次反應500-20000細胞PCR反應最佳
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